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台湾金线莲转录组特性研究 认领 被引量:7
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作者 姜福星 魏丕伟 +2 位作者 寇亚平 贾茵 陈其兵 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期2743-2753,共11页
台湾金线莲(Anoectochilus formosanus)是我国传统的珍贵药材,素有"金草"、"神药"等美称,具有很高的药用价值、观赏价值和经济价值。台湾金线莲的全草入药,且挥发油中也含有多种药用成份。本研究采用Illumina Hi Se... 台湾金线莲(Anoectochilus formosanus)是我国传统的珍贵药材,素有"金草"、"神药"等美称,具有很高的药用价值、观赏价值和经济价值。台湾金线莲的全草入药,且挥发油中也含有多种药用成份。本研究采用Illumina Hi Seq 2000高通量测序技术,对其全草进行转录组分析,共获得原始数据5.3 Gb,有效数据4.4 Gb,Unigene有173 513条,Unigene平均长度为680 bp;通过与其他核酸、蛋白质数据库的Blast比对,58 451条得到Nr功能注释,21 386条得到COG功能分析,45 812条GO功能解释。KEGG代谢途径研究发现,130条Unigene与黄酮类物质有关,114条Unigene与生物碱有关,441条Unigene与萜类物质有关。搜索发现21 195个微卫星位点,其中单核苷酸最多有13 126个,占61.93%,其次分别是三核苷酸和二核苷酸,分别占17.4%和15.61%。 展开更多
关键词 台湾金线莲 转录组分析 药用活性成份 微卫星标记
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